由于对杀菌剂的着眼点不同，对其分类方法有许多种。一般常见的有以下几种。
　　1、按化学组成和分子结构划分类
　　这种分类方法是依据药剂分子的化学元素组成和分子结构类型进行划分的。根据这种划分，有无机杀菌剂和有机杀菌剂两大类，其中根据分子中组成元素的种类不同，可分为元素硫、铜、汞及有机硫、有机汞、有机氯、有机磷等杀菌剂。有机杀菌剂中又根据其化学结构的不同，还可再分为二硫化氨基酸类、多菌灵类、甲霜灵类等若干小类。
　　2、按杀菌剂的使用方式分类
　　这种分类方法是根据药剂的使用方法进行划分。如有叶面喷洒剂、种子处理剂、土壤处理剂（插种前处理或作物生长期使用）、根部浇灌剂、果实保护剂和烟雾熏蒸剂等。
　　3、按杀菌剂的作用方式划分
　　该种分类方法是依据药剂对防治对象（如植物）的作用方式进行的分类。具体分类如下：
　　（1）保护性杀菌剂
　　保护性杀菌剂是指仅在病原菌侵入寄主并在其阻止内部形成侵染之前施药，从而防止致病菌的侵染，能发挥这种作用的撒谎军机 保护性杀菌剂。这类杀菌剂一般不能浸透到植物体内，而在植物表面形成毒性屏障来保护植物不受病原菌的侵害。其特点是保护施药处受病菌侵染。
　　（2）治疗性杀菌剂
　　治疗性杀菌剂是指在病原菌感染后施药，从而消灭或抑制在寄主组织内部形成侵染的病原菌的杀菌剂。
　　（3）铲除性杀菌剂
　　铲除性杀菌剂是指病原菌已侵染到寄主，然后在感染处施药，从而根除患病处（及感染的病菌繁殖点周围的寄主区域）的病原菌的杀菌剂。简而言之，这种杀菌剂能够治疗在施药处已形成的侵染。
　　（4）内吸性杀菌剂
　　内吸性杀菌剂是指能够进入到植物体内，从而产生杀菌或抑菌作用的杀菌剂。它与保护性杀菌剂和局部化学治疗机（或铲除剂）的不同点在于，它能防止病害在植株上远离施点的部位发展。
　　内吸性杀菌剂根据其在寄主内的运转和传导方式又可分为共质体內吸剂、非共质体內吸剂以及双流向內吸剂。共质体內吸剂是在植物的韧皮部的筛管里由页部传至根部。这种传导是下行性的，其运输是需要消耗代谢能量的主动性运输。非共质体内吸剂，又称为非原质体內吸剂，是在植物的木质部的导管里，随蒸腾流很快地由根部传至叶部。这种传导是上行性的，其运输是不需要消耗代谢能量的被动性运输。
　　内吸性杀菌剂多数都具有保护和治疗作用，有的还具有铲除作用。由于其所具备的內吸特性，所以能耐风雨冲刷。与非内吸性杀菌剂相比，它们的抑菌效果好，选择性强。但较易产生抗药性（即对病原菌作用的不敏感性）。对病原菌的作用抑制往往是单一性（单个作用点）的。
　　（5）非内吸性杀菌剂
　　非内吸性杀菌剂与内吸性杀菌剂相反，这类杀菌剂不能渗透植物的角质层，故不能被植物吸收和传导。其防病的主要功能是在植物表面形成毒性屏障。因此，未被覆盖的植物表面就得不到保护，对新生长部分需要用药剂覆盖，故用药次数多，其功能一般为保护作用。其杀菌作用机制多为干扰菌体能量代谢过程（抑制呼吸），而且往往是多位点的发生作用，因此不易产生抗药性。
　　杀菌剂在寄主（植物）体内移动和防治病害时可能的作用，额可以归纳为表4-1.
　　4、按对病原菌的作用机制划分
　　这种分类方法是依据妖姬对病原菌的杀灭或抑制的机制或历程，分为能量生成抑制剂和生物合成抑制剂两大类。前者属于干扰能量代谢过程，后者属于干扰物质代谢过程。根据干扰的具体过程和物质种类不同，上述两大类又各自细分为若干小类。如能量生成（有时也称生物氧化或细胞呼吸）抑制剂又分为（-sh）抑制剂、电子传递抑制剂、氧化磷酸化抑制剂、解抑制剂、脂肪酸-氧化抑制剂等；生物合成抑制剂又分为细胞壁功能及其合成抑制剂、细胞膜功能及其合成抑制剂、蛋白质合成抑制剂、核酸合成抑制剂等。

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